الصحة الواحدة: ترصّد مسببات الأمراض واكتشاف مركبات مضادة للميكروبات

ترصّد مسببات الأمراض المنقولة بالقُراد في الثروة الحيوانية السعودية

يتغذى القُراد على الإبل ويحمل بداخله بكتيريا، وبعضها يصيب الإنسان. ولا تزال معرفتنا بمسببات الأمراض وجينات مقاومة المضادات التي يحملها قُراد الإبل في المملكة محدودة، ولا سيما من حيث الاختلاف بين المناطق والأهمية الصحية للعزلات القابلة للزراعة. هذه الفجوة هي المشروع.

ستقوم بكل خطوة بنفسك:

1. جمع القُراد من الإبل ميدانياً — في حائل والمدينة المنورة والرياض.
2. استخلاص الحمض النووي من القُراد.
3. الكشف عن الممرضات التي يحملها، بتقنية PCR وتسلسل 16S rRNA.
4. زراعة البكتيريا واختبار مقاومتها للمضادات الحيوية.
5. إجراء التسلسل الجيني للعزلات المهمة، ثم نشر النتيجة.

وقد أكملنا هذا المسار كاملاً مرة من قبل — من الميدان إلى جينوم منشور. أي أنك ستوسّع عملاً مُثبتاً، لا أن تبدأ من الصفر.

Hyalomma dromedariiيشمل العمل الميدانيMicroorganisms 2026;14(7):1428

بناء نموذج حي لدراسة مقاومة مضادات الميكروبات

لاختبار ما إذا كان علاجٌ ما فعّالاً، تحتاج إلى عائل حي. وعائلنا هو دودة Caenorhabditis elegans — صغيرة، ورخيصة، وسريعة، وترتبط بقيود أخلاقية أقل من النماذج الفقارية.

ولهذا المسار شقّان. الأول عزل وتوصيف سلالات سعودية محلية من دودة C. elegans من التربة، بهدف إنشاء سلالات محلية موصوفة ومتاحة لأبحاث المختبر. والثاني استخدام هذا النموذج لدراسة العدوى ولاختبار المركبات المضادة للميكروبات داخل عائلٍ حي، وليس في الاختبارات المخبرية وحدها.

وما تبنيه في هذا المسار يبقى في المختبر، ويعمل به من يأتي بعدك.

عزل سلالات محليةاختبارات التغذية والقتل

فحص المركبات بحثاً عن نشاط مضاد للميكروبات

البكتيريا المقاومة تتجاوز مضاداتنا الحيوية بسرعة. ويبحث هذا المسار عمّا قد يحل محلها.

ستختبر مركبات حقيقية على بكتيريا مقاومة حقيقية — مستخلصات نباتية، ومستخلصات طحالب، وجسيمات فضية نانوية — بقياس MIC وMBC واختبارات الأغشية الحيوية. ويضم مجمّدنا الحالات الصعبة، منها MRSA، وAcinetobacter شديدة المقاومة، وعزلة Pseudomonas aeruginosa قاومت كل دواء اختُبر عليها.

MIC · MBC · biofilm135 عزلة

الحوسبة والذكاء الاصطناعي

ليس كل بحثٍ يحتاج مختبراً. وهذا المسار قائم بذاته، ويناسب طالباً يريد أن ينشر مبكراً، أو لا يستطيع قضاء ساعات طويلة على الطاولة المخبرية.

ما نعمل به اليوم: الفحص الحاسوبي للمركبات الدوائية على معالجات رسومية — الالتحام الجزيئي، والديناميكا الجزيئية، والتنبؤ بسلامة المركب وقابليته للامتصاص. والنمذجة الرياضية للمفاتيح التنظيمية في البكتيريا. وتعلّم الآلة في دراساتنا الإكلينيكية: نماذج تنبؤية على بيانات المرضى مع القدرة على تفسير العوامل التي أسهمت في تنبؤ النموذج. وطرح أسئلة جديدة على قواعد بيانات عامة ضخمة موجودة بالفعل.

أسئلة مفتوحة نرحّب بمن يعمل عليها: هل يمكن تعليم نموذج أن يميّز البكتيريا من بياناتها المخبرية؟ وهل يمكن التنبؤ بمقاومة العزلة للمضادات قبل أن تكتمل نتيجة الاختبار؟ وهل يمكن بناء نظام يساند أخصائي المختبر في القرار التشخيصي؟

وإن كان لديك تصوّر آخر في الذكاء الاصطناعي أو المعلوماتية المخبرية، فأخبرني وسنصوغ المشروع حوله.

GDC/TCGA · GEO · NCBI SRA

دراسة المرضى من سجلات موجودة أصلاً

الدراسة الاسترجاعية تطرح سؤالاً جديداً على سجلات مرضى جمعتها المستشفيات بالفعل. فلا تنتظر عيّنات، ولا تنتظر تشغيل جهاز تسلسل، وتوجد بروتوكولات معتمدة يمكن أن ينطلق منها المشروع، وفق نطاق السؤال ومتطلبات الجهة.

وهذا مهم في الماجستير: المدة قصيرة، والنطاق محدد، والمشروع المُدار جيداً قد يتيح الوصول إلى مسودة قابلة للنشر أثناء الدرجة.

أمثلة على نوع الدراسة التي ستتعلم إجراءها. هذه أربع دراسات نشطة في المختبر، ولكل منها بروتوكول معتمد في مستشفى تعليمي بالرياض. ولن نسلّمك إحداها لتنفّذها فحسب — بل ستتعلم المنهجية عليها، ثم تصمم سؤالك أنت بالطريقة نفسها:

1. جرثومة المعدة Helicobacter pylori — العدوى ونتيجة العلاج عبر الزمن.
2. التهاب المسالك البولية لدى الأطفال المولودين بتشوهات كلوية خِلقية.
3. عدوى مجرى الدم لدى البالغين.
4. الإنتان متأخر البداية لدى حديثي الولادة.

ما ستتعلمه: كيف تبني مجموعة مرضى نظيفة، والتنبؤ بتعلّم الآلة مع القدرة على تفسير العوامل التي أسهمت في تنبؤ النموذج، وتحليل البقاء، وكيف تكتب تقرير دراسة إكلينيكية وفق إرشادات STROBE بما يعزز وضوح التقرير واكتماله.

ومسار التحليل مبنيٌّ ومُختبَر مسبقاً، فتقضي سنتك على سؤالك أنت، لا على ابتكار المنهجية.

Cox · Kaplan–MeierSTROBEبروتوكولات معتمدة